食道真菌感染可能引發多種并發癥，如食道狹窄、穿孔、出血、營養不良、感染擴散等。身體不適時，應盡快尋求專業醫療意見，遵循醫生的建議進行治療，切莫自行開處方。
1.食道狹窄：真菌侵襲導致食道組織增生，管腔變窄，影響吞咽。
2.食道穿孔：嚴重感染破壞食道壁，造成穿孔，引發縱隔炎癥。
3.出血：炎癥損傷血管，引起食道內出血。
4.營養不良：吞咽困難影響進食，導致營養攝入不足。
5.感染擴散：真菌可蔓延至其他器官，如肺部，引發更嚴重感染。
食道真菌感染并發癥危害較大，一旦確診應及時規范治療，預防并發癥發生。

真菌性食管炎癥狀多不典型,主要表現為吞咽疼痛,吞咽不暢,胸骨后不適及燒灼感,咽部不適,病程呈慢性經過.其中無食管癥狀約占45.3%,很少在胃鏡檢查前考慮診斷,多在胃鏡檢查中發現,鏡下主要表現為隆起白斑,粘膜充血,糜爛,潰瘍,粗糙,變脆,糜爛甚至潰瘍形成,嚴重者出現增生及管腔狹窄.病變以中下段嚴重,很少累及齒狀線.食管涂片鏡下觀察可見大量真菌菌絲和孢子,特別是菌絲的存在表示念珠菌處于致病狀態,意義較大,可明確診斷,如只檢到少量孢子應結合鏡下表現及病理學檢查,可能為口腔的路過菌.病理學檢查見真菌分布于實質細胞內,病變組織中廣布成簇的菌絲和孢子,呈多發性膿腫,肉眼有時難與糜爛性結核及轉移癌區別,顯微鏡下呈急性炎癥反應,有以中性粒細胞浸潤為主的微膿腫.嚴重病例可出現細胞的異形增生及惡變.

真菌性食管炎癥狀不典型,早期診斷困難,部分患者不能及時得到有效治療,而且抗真菌藥物副作用較大,鑒于其與食管賁門癌關系密切,更應引起廣泛關注.電子胃鏡檢查結合涂片,病理檢查是診斷真菌性食管炎的最準確的手段,長期應用抗生素,免疫抑制劑的患者,糖尿病,營養不良等病人應想到真菌性食管炎的可能,必要時行胃鏡檢查.