巧克力囊腫是子宮內膜異位癥的一種常見表現，其是否需要手術取決于多種因素，如囊腫大小、癥狀嚴重程度、生育需求、患者年齡、有無惡變傾向等。 1. 囊腫大小：一般來說，直徑大于 50mm 的巧克力囊腫手術治療的可能性較大。但 40mm 的囊腫，如果癥狀明顯，藥物治療效果不佳，也可能需要手術。 2. 癥狀嚴重程度：如果痛經難以忍受，影響到正常生活和工作，即便囊腫稍小，也可能考慮手術。 3. 生育需求：對于有生育需求的女性，若囊腫影響受孕，可能會選擇手術以提高受孕機會。 4. 患者年齡：年輕患者可能更傾向于先保守治療，而接近絕經的患者，手術可能更利于病情控制。 5. 惡變傾向：若檢查提示有惡變可能，無論囊腫大小，都應手術。 總之，對于 40mm 大小的巧克力囊腫是否手術，需要綜合多方面因素，由醫生根據具體情況評估后決定。患者應積極配合醫生的檢查和治療建議。

正常情況下，子宮內膜生長在子宮腔內，受女性體內激素影響，每月脫落形成月經。當脫落的內膜隨經血逆流到卵巢內，就會形成巧克力囊腫。由于每個人的情況不一樣，建議患者盡早到正規醫院詳細檢查，明確病情治療。