癲癇手術治療效果不好可能與多種因素有關，如致癇灶定位不準確、術后出現新的致癇灶、患者自身的神經功能障礙、術后并發癥以及術后未規范用藥等。 1.致癇灶定位不準確：如果術前對癲癇發作的起源部位判斷有誤，手術無法精準切除或處理致癇灶，就可能導致治療效果不佳。 2.術后出現新的致癇灶：患者的腦部在術后可能因各種原因產生新的致癇灶，從而引發癲癇發作。 3.患者自身的神經功能障礙：部分患者本身存在嚴重的神經功能問題，影響了大腦的正常電活動調節，使手術效果受限。 4.術后并發癥：例如感染、出血、腦損傷等并發癥，可能影響大腦功能，導致癲癇控制不理想。 5.術后未規范用藥：手術后仍需遵醫囑服用抗癲癇藥物，如果患者擅自減藥、停藥或不規律用藥，也會影響治療效果。 總之，癲癇手術治療效果不佳是由多種因素綜合作用的結果。患者在接受手術治療后，應密切配合醫生進行后續的治療和隨訪，以提高治療效果。

(1)顱內病變有時為致癇灶的一部分或緊鄰致癇灶，由于生理和解剖的限制，致使病變周圍致癇灶切除不徹底，此種情況約占顱內病變所致癲癇病人術后需再次手術的23%。 　　(2)致癇灶范圍廣或致癇灶范圍難以確定，手術難以徹底切除。 　　(3)繼發性癲癇灶處理不當，致使術后癲癇繼續發作，此種情況約占所有再次手術患者的20%～62%。 　　(4)顳葉癲癇的雙重病理改變處理不當，顳葉內側結構切除范圍不夠，殘存杏仁核過大，只切除一側病變等，均可導致癲癇發作。 　　(5)手術創傷、電生理定位錯誤、臨床表現定位錯誤、手術方式選擇錯誤、術后抗癲癇藥物應用不當等也可導致癲癇術后發作。 　　(6)癲癇誘因作用，癲癇術后患者發生頭外傷、過度飲酒、腦炎、高熱、相關藥物作用、驚嚇、過度勞累、遺傳易感因素等，均可導致癲癇術后發作。 　　(7)手術方式認識錯誤，手術本身就有失敗的可能性，如胼胝體切開術癲癇控制改善只有20%～90%不等；迷走神經刺激術治療癲癇總有效率為50%～70%。