肛門內兩側痛，用藥后仍隱痛，可能是痔瘡未愈、肛周膿腫、肛竇炎、肛裂、直腸息肉等原因所致。 1.痔瘡未愈：痔瘡若治療不徹底或病情較重，即便用藥，癥狀也可能持續存在。內痔或混合痔可能導致肛門內隱痛。 2.肛周膿腫：多由細菌感染引起，初期可能表現為肛門內隱痛，之后疼痛加劇，伴有發熱等癥狀。 3.肛竇炎：肛竇發生炎癥，可引起肛門內墜脹、隱痛，排便時癥狀可能加重。 4.肛裂：肛管皮膚破裂形成肛裂，排便時和排便后會有劇痛，也可能出現肛門內隱痛。 5.直腸息肉：息肉較大或有炎癥時，可引起肛門內不適感和隱痛。 出現這種情況，建議及時到正規醫院肛腸科就診，進行肛門指診、肛門鏡等檢查，明確病因后進行針對性治療。治療期間要注意保持肛門清潔，飲食清淡，避免久坐。

單從描述不好確診，可以到正規醫院肛腸科就診做一下身體檢查，明確病因再進行藥物治療，平時注意不要吃辛辣食物，避免便秘。

建議到正規醫院肛腸科就診做一下檢查，明確診斷后再進行治療，平時注意不要吃辛辣食物，避免便秘，不要長時間保持坐姿。