分期與分型：本病潛伏期4-21天,多為10-14天.病期分為初熱期(3-4天),極期(5-7天),恢復期,后遺癥期.臨床分為4型.1.輕型：體溫38-39%左右,神志清楚,無驚厥,腦膜刺激征不明顯,輕度頭痛,嘔吐,嗜睡,病程5-7天.2.普通型：體溫39-40℃左右,明顯煩躁,嗜睡或淺昏迷,偶有驚厥或局部抽搐,腦膜刺激征明顯,病理反射陽性,病程10天左右.3.重型：持續高熱40℃以上,反復或持續驚厥,肢體強直,昏迷,有明顯的顱內高壓癥狀及腦膜刺激征,病程2周以上.少數患兒留有后遺癥.4.極重型(暴發型)：體溫迅速上升達40℃以上,驚厥不止,迅速出現昏迷,有呼吸衰竭表現,多于3-5天內死亡,幸存者可有嚴重后遺癥.

腦脊液呈無色透明，壓力僅輕度增高，白細胞計數增加，糖正常或偏高，蛋白質常輕度增高

乙腦的組織學改變有：神經細胞變性、壞死；軟化灶形成；腦血管改變；膠質細胞增生早期有高熱、周身不適等癥狀，是由病毒血癥所致。由于神經細胞變性、壞死，可出現嗜睡、昏迷、抽搐等。由于腦實質血管充血，腦組織水腫，顱內壓升高，可出現頭痛、嘔吐，嚴重者可致腦疝形成，繼而壓迫延髓呼吸、循環中樞導致呼吸、循環衰竭而死亡。由于腦膜可有輕度的炎癥反應，故可出現輕度腦膜刺激癥狀。