男性生殖器官有分泌物且小便疼痛，可能是尿道炎、前列腺炎、淋病、非淋菌性尿道炎、尿路結石等原因引起。 1.尿道炎：多由細菌感染導致，常見致病菌有大腸桿菌等。癥狀包括尿道口紅腫、尿頻、尿急、尿痛，可有膿性分泌物。治療常使用抗生素，如左氧氟沙星、頭孢呋辛酯、阿莫西林等。 2.前列腺炎：可分為急性和慢性。急性前列腺炎多由細菌感染引起，慢性前列腺炎病因復雜。會出現尿頻、尿急、尿痛、會陰部疼痛等癥狀。治療包括抗菌藥物（如環丙沙星）、α受體阻滯劑（如坦索羅辛）等。 3.淋?。河闪懿∧紊腥疽?，是一種性傳播疾病。尿道口有大量黃色膿性分泌物，伴有尿痛。治療以抗生素為主，如頭孢曲松鈉、大觀霉素等。 4.非淋菌性尿道炎：常見病原體有支原體、衣原體等。癥狀較淋病輕，分泌物稀薄。常用藥物有阿奇霉素、多西環素等。 5.尿路結石：結石刺激尿路黏膜可引起疼痛和分泌物。較小的結石可通過多喝水、運動排出，較大的結石可能需要體外沖擊波碎石或手術治療。 出現生殖器官有分泌物且小便疼痛的癥狀，應及時到正規醫院泌尿外科就診，進行相關檢查，明確病因后進行針對性治療。同時，要注意個人衛生，多喝水，避免不潔性行為。

可能是有尿路感染了,需要檢查一下尿常規.