小便結束時生殖器官痛可能由尿道炎、膀胱炎、前列腺炎、尿路結石、生殖器損傷等因素引起。 1.尿道炎：尿道黏膜發生炎癥，病原體感染是常見原因，如細菌、支原體、衣原體等。癥狀除了尿痛，還可能有尿頻、尿急。治療常使用抗生素，如左氧氟沙星、頭孢呋辛酯、阿奇霉素等。 2.膀胱炎：多由細菌感染導致，如大腸埃希菌。除了尿痛，還會有下腹疼痛、血尿等。治療藥物包括磺胺嘧啶、阿莫西林等。 3.前列腺炎：可分為急性和慢性，炎癥刺激會引起尿痛。常用藥物有環丙沙星、坦索羅辛等。 4.尿路結石：結石刺激尿路黏膜，導致疼痛。較小的結石可通過多喝水、運動排出，較大的結石可能需要體外沖擊波碎石或手術治療。 5.生殖器損傷：外傷或性生活過于劇烈等導致生殖器損傷，也會引起疼痛。一般需要休息，必要時進行局部處理。 總之，出現小便結束時生殖器官痛的情況，應引起重視。建議及時到正規醫院泌尿外科就診，進行相關檢查，如尿常規、B 超等，以明確病因，并在醫生的指導下進行治療。

這個有可能是缺鈣的原因。可以及時的補充看看。同時注意休息。

這個不排除膽囊炎或是泌尿系感染的原因。所以必須進一步的檢查看看。