亞急性非化膿性甲狀腺炎的病理較為復雜，主要涉及病毒感染、自身免疫反應、炎癥細胞浸潤、甲狀腺濾泡結構改變以及甲狀腺激素水平變化等。 1.病毒感染：常由柯薩奇病毒、流感病毒等引起，病毒直接侵襲甲狀腺組織，引發炎癥反應。 2.自身免疫反應：機體免疫系統異常，產生針對甲狀腺的自身抗體，導致甲狀腺損傷。 3.炎癥細胞浸潤：大量的淋巴細胞、巨噬細胞等炎癥細胞浸潤甲狀腺，釋放炎癥因子，加重組織損傷。 4.甲狀腺濾泡結構改變：濾泡上皮細胞破壞，膠質外溢，濾泡結構紊亂。 5.甲狀腺激素水平變化：炎癥早期，甲狀腺濾泡內儲存的甲狀腺激素釋放入血，引起甲狀腺毒癥；后期甲狀腺組織修復，甲狀腺功能可恢復正常或出現甲減。 總之，亞急性非化膿性甲狀腺炎是多種因素共同作用的結果，其病理變化會導致甲狀腺功能的異常和相應的臨床癥狀。

亞甲炎常在病毒感染后1-3周發病，可表現出甲狀腺毒癥階段、甲減階段即甲狀腺功能恢復階段。一般整個病程約6-12個月。有些病例反復加重，持續數月至2年不等

亞急甲狀腺炎，全身癥狀較重、甲狀腺腫大明顯、壓痛也明顯，可使用腎上腺糖皮質激素治療，亦可以聯合非甾體類抗炎藥治療。如果癥狀輕者，休息并非甾體類抗炎藥（如阿司匹林）治療即可。

亞急甲狀腺炎，慎用含碘過高食物甲亢并非因缺碘而致，使用碘治療應遵照醫師指導準確使用碘的劑量。否則飲食中大量攝碘，如海帶、海藻、昆布等，影響醫生對病情的判斷與分析，將干擾臨床治療。