沙眼衣原體感染治療在很多工業化國家中沙眼衣原體所致的性傳播疾病增加很快,目前它所引起的生殖道感染的發病率已超過淋球菌感染.衣原體感染可以有癥狀或無癥狀,亞臨床感染可持續存在較長時間,并且與有癥狀的衣原體感染一樣可導致附睪炎及輸卵管炎,造成嚴重的后果,如不育癥及輸卵管妊娠.產褥期及圍生期的衣原體感染可導致嬰兒肺炎.沙眼衣原體感染治療,沙眼衣原體的分離率在下列人群中最高：同性戀者,社會經濟地位較低者,性活躍的年輕人,性侶多的人及未經產的婦女.

沙眼衣原體感染易并發附睪炎，表現為附睪腫大，變硬及觸痛，多為單側，部分患者的抗沙眼衣原體抗體升高，可直接從附睪抽吸液中分離出沙眼衣原體；累及睪丸可出現睪丸炎，表現為睪丸疼痛、觸痛、陰囊水腫及輸精管變硬變粗；累及前列腺時可出現后尿道、會陰及肛門部位鈍痛或觸痛，可有性功能障礙，直腸鏡檢可觸及有壓痛的前列腺。如前列腺明顯腫大，可壓迫后尿道而出現尿流變細、排尿無力及尿流中斷等；本病還可以合并Reiter綜合征，即關節炎，結膜炎，尿道炎三聯癥。衣原體對作用于細胞壁的藥物耐藥，如青霉素類、萬古霉素、桿菌肽，如四環素、紅霉素等。