慢性乙肝的復發幾乎是不可避免的，但復發并不可怕，面對復發的策略是再治療，并且是力爭及早再治療。及時、正確應用抗HBV藥物進行再治療，仍然可抑制HBV的復制并取得良效。對復發的治療要持之以恒。難治的另一些原因是慢性乙肝的發病機制還沒有全部搞清，HBV復制的細節也不十分清楚。部分乙肝患者常合并丙肝病毒、丁肝病毒的混合感染，或伴有脂肪肝、膽道感染等疾病，或因治療過度引起藥物性肝損傷，都會增大治療的難度。

乙肝病毒的繁殖是以復制形式進行的，它在人體細胞內或肝細胞核內不斷地復制零件，然后再把這些零件組裝成完整的病毒顆粒，在復制時還要有一個模子，學術名詞稱為模板，又叫ccc-DNA，它比較穩定地深藏在乙肝病毒的細胞核內，不斷復制病毒釋放入肝細胞漿和血液中。乙肝患者經常熬夜，飲食不合理，吃了對肝臟有刺激的食物時也會出現肝區疼痛癥狀，對于此類原因引起的肝區疼痛，乙肝患者只要好好調節，肝區疼痛的癥狀就會消失。肝病時肝區疼痛一般不必服用止痛藥，通過休息、合理營養和適當治療，隨著肝病好轉而逐漸消失。肝區痛在部分肝病恢復期或其后仍可出現，表現為間歇性或陣發性，這可以在醫生的疏導后逐步得以減輕緩解。