宮頸性不孕的主要機制是宮頸解剖學異常和宮頸粘液的異常。先天因素主要是指比如宮頸管狹窄和雙宮頸畸形等。此外像是宮頸糜爛、宮頸炎、宮頸息肉等癥狀。宮頸的形態和宮頸黏液的功能直接影響能否有相當數量的精子上游入宮腔獲能，宮頸器質性或功能性疾病影響了精液或精子進入并儲存在宮頸管內，也會導致不孕。

宮頸疾病引起的不孕占不孕癥的5％-10％.宮頸的形態和宮頸黏液的功能直接影響能否有相當數量的精子上游入宮腔獲能宮頸器質性或功能性疾病影響了精液或精子進入并儲存在宮頸管內.子宮頸作為精子通過的第一道關隘其解剖生理上的任何改變均可以影響精子的通過而致不孕.如宮頸粘液分泌過少或過多有抗精子抗體存在都會引發宮頸性不孕.

宮頸及其頸管腺體是卵巢激素的重要靶組織，其解剖學形態和宮頸粘液分泌隨卵巢激素的消長而呈現周期性變化，并與受孕功能密切相關。在月經剛凈時，體內雌激素水平較低，宮頸管分泌的粘液量少。