如果是病毒性的結膜炎可用0.1%的無環鳥苷0.1%的碘苷(皰疹凈)或4%嗎啉雙胍等眼藥水來治療,注意用眼衛生：盡量不用手或異物挑觸眼睛,少看電視,電腦等.加強鍛煉,提高自身免疫力.

了紅眼病后要積極治療,一般要求要及時,徹底,堅持.一經發現,立即治療,不要中斷,癥狀完全消失后仍要繼續治療1周時間,以防復發.治療可沖洗眼睛,在患眼分泌物較多時,宜用適當的沖洗劑如生理鹽水或2%硼酸水沖洗結膜囊,每日2~3次,并用消毒棉簽擦凈瞼緣.也可對患眼點眼藥水或涂眼藥膏.如為細菌性感染,可根據檢查出的菌種選擇最有效的抗生素眼藥水滴眼,根據病情輕重,每2~3小時或每小時點眼藥1次,常用眼藥水有10%~20%磺胺醋酰鈉,0.3%氟哌酸,0.25%氯霉素眼藥水等,晚上睡前可涂抗生素眼膏,如環丙沙星,金霉素或四環素眼藥膏,每次點藥前需將分泌物擦洗干凈,以提高療效.對混合病毒感染的結膜炎,除應用以上藥物治療外,還可用抗病毒眼藥水,如為腺病毒可用0.1%羥芐唑眼藥水,0.1%肽丁胺乳劑,如為小病毒可用0.1%皰疹凈,0.1%無環鳥苷眼藥水等,每日2~3次,必要時還可應用干擾素等.有條件時可進行細菌培養,并作藥敏試驗,以選用適當的抗生素.