堿性磷酸酶是廣泛分布于人體各臟器器官中，其中以肝臟為最多其次為腎臟，骨骼、腸、和胎盤等組織。堿性磷酸酶偏高預示著肝臟異常，堿性磷酸酶偏高時，有可能是肝囊腫、肝結核、阻塞性黃疸、繼發性肝癌和原發性肝癌等；堿性磷酸酶偏高預示著骨骼疾病，堿性磷酸酶偏高時，有可能是骨軟化癥、骨折愈合期、骨細胞癌和惡性腫瘤骨轉移等；堿性磷酸酶偏高預示著白血病、甲狀腺機能亢進。

肝膽疾病:阻塞性黃疸、原發性肝癌、繼發性肝癌、膽汁淤積性肝炎等。白血病、甲狀腺機能亢進時，血清堿性磷酸酶亦可升高。

由于骨組織中此酶亦很活躍。因此，孕婦、骨折愈合期、骨軟化癥。佝僂病、骨細胞癌、骨質疏松等血清堿性磷酸酶會升高。

肝臟受到損傷或者障礙時經淋巴道和肝竇進入血液，同時由于肝內膽道膽汁排泄障礙，反流入血而引起血清堿性磷酸酶明顯升高。[還有生理性原因，如骨骼發育期、骨折愈合期，這些情況下骨組織中的堿性磷酸酶很活躍，所以檢測時值會偏高。