3 歲男童牙齦長膿包可能由多種原因引起，如口腔衛生不良、齲齒、牙周炎、根尖周炎、免疫力下降等。 1. 口腔衛生不良：兒童可能未養成良好的刷牙習慣，食物殘渣堆積，滋生細菌，引發炎癥和膿包。 2. 齲齒：牙齒齲壞，細菌侵入牙髓，炎癥擴散到根尖，形成膿包。 3. 牙周炎：牙齦炎癥蔓延，破壞牙周組織，導致牙周膿腫。 4. 根尖周炎：牙髓感染未及時治療，炎癥擴散至根尖周圍組織，形成膿包。 5. 免疫力下降：孩子身體抵抗力弱，容易受到細菌侵襲，引發牙齦問題。 總之，家長應重視孩子的口腔健康，一旦發現牙齦長膿包，及時帶孩子到正規醫院口腔科就診，明確病因，采取相應的治療措施。

根尖周膿腫,需要行根管治療術,這種方法是目前國際公認最先進，最科學的治療牙痛的有效方法。其它方法大多是治標不治本，或是容易復發。如果膿包還是不消失,只能說那醫師的水平有問題了.建議找一個專家,行根管治療,希望你的小孩早日解除困擾.

建議去醫院查明病因，遵醫囑服藥