急性結膜炎用藥后眼睛流水可能是過敏，也可能是疾病本身的發展、藥物刺激、淚道問題、眼部疲勞等。 1. 過敏：部分人可能對所用藥物中的某些成分過敏，導致眼睛出現流水等不適。 2. 疾病發展：急性結膜炎病情未得到有效控制，炎癥刺激加重，也可能出現這種情況。 3. 藥物刺激：某些眼藥水的酸堿度或滲透壓不合適，對眼部產生刺激。 4. 淚道問題：本身存在淚道狹窄或阻塞，用藥后可能影響淚液排出。 5. 眼部疲勞：患病期間仍過度用眼，使眼部疲勞，淚液分泌增加。 總之，出現用藥后眼睛流水的情況，建議及時復診，醫生會根據具體情況調整治療方案。同時，要注意眼部休息，避免揉眼，保持眼部清潔。

急性結膜炎俗稱“紅眼病”.多發于春季,為季節性傳染病,它傳播途徑主要是通過接觸傳染.往往通過接觸病人眼分泌物或與紅眼病人握手或用臟手揉眼睛瞪被傳染.如果是過敏的話一般會出現眼睛的極度不適,如果要提高治療效果的話建議局部治療和全身治療相結合,全身應用抗生素,一般急性結膜炎是由于支原體或者衣原體,另外還有病毒感染引起,所以在治療上這幾點要兼顧,可以服用一些抗支原體,衣原體以及病毒的藥物,效果比較好的是琥乙紅霉素,四環素,金剛烷胺等口服藥,局部點滴一些抗生素的眼藥水,如利福平眼藥水,左氧氟沙星眼藥水,還可以應用一些腎上腺糖皮質激素眼藥水,如氫化可的松滴眼液等,再結合吃一些清熱解毒的中成藥,如黃連上清膠囊,牛黃解毒片,牛黃上清膠囊等,平時注意用眼衛生,禁止熬夜,飲食宜清淡,不要吃刺激性食物,多喝水等.

建議可以用點阿昔洛韋眼藥水外用，同時配合紅霉素眼膏治療效果較好，同時注意不宜食用過于油膩，辛辣刺激性食物，注意眼部的清潔衛生，相信是會很快好起來的。