如明確診斷,可考慮保留囊腫,畢竟囊腫損害腎臟的情形罕見.當囊腫并發感染時,應加強抗菌素治療.囊液中抗菌素所能達到的濃度很低.因而常常需行經此穿刺引流.經此穿刺引流失敗的話,采取手術切除囊腫壁的腎外部分并引流,也被證明療效頗佳.發生腎積水時,切除引起梗阻的囊腫壁可以解除輸尿管梗阻.累及腎臟的腎盂腎炎提示存在尿路梗阻,繼而輸尿管引流不通暢.切除囊腫后,自然就緩解了尿路壓力從而使抗菌治療更為有效.

腎囊腫或腎臟囊性疾病是腎臟內出現與外界不相通的囊性病變的總稱。常見的腎囊腫如單純腎囊腫、腎盂旁囊腫以及多囊腎等等。腎囊腫多數屬于先天性（遺傳性），少數是后天性的或未定性的。單純腎囊腫進展緩慢，預后良好，無自覺癥狀或壓迫梗阻等病變者，不須外科治療干預，亦不需口服藥物，不影響日常生活，半年或一年復查一次B超即可。