治療利福平加乙硫異煙胺和乙胺丁醇的聯合治療有滿意療效。推薦方案是：1.對本菌引起的感染，用利福平加乙胺丁醇治療2個月后減少用藥劑量,乙硫異煙胺和維生素B6共四種藥，治療18個月。2.由于利福平顯著增加藥物代謝，在應用HIV蛋白酶抑制劑時，不能同時用利福平，可用低劑量利福噴汀。3.伴嚴重感染時，如空洞或播散性感染，可先用氨基糖苷類抗生素，如給予鏈霉素每周治療3～5天，直到痰培養陰性。4.對兒童淋巴結炎，推薦切除所有可觸及的淋巴結，并配合藥物治療。

本病主要在溫帶地區流行。隨著人類免疫缺陷病毒的流行，在HIV感染者中發病報道有增加，目前本病在艾滋病患者的常見分枝桿菌感染中占第二位。

NTM對于人類致病的潛能不盡相同。總體來說，作為一個類別，對于人類的致病毒性不像結核分枝桿菌那么強烈，可以移生于人體表面和分泌物，不致引起疾病。組織侵襲一般是事出有因，即發生在已有局部或系統性防御機能障礙的宿主。堪薩斯分枝菌侵入受傷的皮膚傷口，可發生局限性皮損，主要引起肺部感染。患病者最好住院觀察治療，一般是可以康復的。