1.抗生素惠普爾綜合征經適當抗生素治療，臨床癥狀可很快緩解，發熱和關節炎可在數天內得到控制。首選青霉素80萬單位肌內注射，每6小時1次；或紅霉素1.0g靜脈點滴，1次/d。也可用四環素2g/d，靜脈滴注；鏈霉素1g，分2次肌注。其他抗生素如氯霉素、氨芐西林(氨芐青霉素)、多西環素(強力霉素)及磺胺甲惡唑等，均可選用。共用7～14天。之后改為四環素2.0g/d，分4次口服。上述藥物可單獨使用，也可聯合使用。當合并細菌性心內膜炎時，應給予大劑量有效抗生素靜脈滴注，直到感染得到控制為止。　　2.糖皮質激素如出現繼發性腎上腺功能不全，應給予替代療法。　　3.其他若脫水嚴重，應給予適當糾正，同時加強營養，糾正低蛋白血癥，可輸全血或血漿。長期吸收不良的病人，可造成維生素K、維生素B12、維生素D等多種維生素缺乏，同時還可出現低血鈣、低血鎂及低血鉀等，都應給予適當補充。對合并細菌性心內膜炎的病人，在治療過程中一旦出現心力衰竭，即應靜脈注射適量洋地黃(毛地黃)制劑加以控制。關節疼痛可用吲哚美辛等治療。

抗生素治療　抗生素應用之前，惠普爾病的病死率很高。最常用的抗生素是四環素，可以單獨使用，也可于腸道外應用青霉素、鏈霉素之后使用。一般7～21天后，大多數患者的臨床癥狀會有明顯改進，但中樞神經系統、心內膜、心包、肺受累時，癥狀改善需要的用藥時間較長。重度中樞神經系統受累，對抗生素治療不敏感，有學者應用利福平治療，療效較佳。抗生素治療后，8%～35%的患者l～4年后復發，若沒有神經系統癥狀，抗生素治療療效仍佳，神經系統癥狀的出現提示預后不良，病死率較高。復發大多發生于治療不足6個月的患者，但事實上，抗生素的正確選擇比治療時間更為重要，有學者證實治療1年和2年以上，復發率沒有明顯差別。甲氧芐胺嘧啶磺胺甲基異惡唑(TMP--SMZ)的應用，可以減少復發率。Relman(1997)建議治療初發惠普爾病，先用青霉素G120萬單位，肌注，每天1次，并加鏈霉素1g，肌注，每天1次，14天后，改用TMP-SMZ160～800mg，口服，每天2～3次，連用1年。