幽門螺桿菌感染病因，幽門螺桿菌革蘭染色陰性，常作S形或弧形彎曲，有1～3個螺旋，長2.5～4.0μm，寬0.5～1.0μm，延長培養時間或藥物治療后，常呈類球形。菌體兩端鈍圓，菌體的一端或兩端有2～6條帶鞘的鞭毛，鞭毛長約為菌體的1.0～1.5倍，粗約為30nm，各有著毛點，著毛點不內陷，鞭毛末端呈圓球狀或卵圓形。細胞壁光滑，與上皮細胞膜緊密相貼。在鞭毛根部內側的細胞質末端有一明顯的電子密度降低區，可能與鞭毛運動的能量貯存有關。貓胃螺桿菌和海爾曼螺桿菌均為3～12個緊密的螺旋，與Hp極易區別。人胃活檢標本分離的Hp菌株有多樣性基因表型，至少可分為兩大類型：Ⅰ型為有細胞毒相關基因A，表達CagA蛋白及空泡毒素；II型無Cag A，既不表達Cag A蛋白，也不表達Vac A。Hp是一種專性微需氧菌，其穩定生長需依靠在生長的微環境中含5%～8%的氧氣，在大氣和絕對厭氧環境中均不能生長。Hp生長緩慢，通常需3～5天，才能形成針尖狀小菌落(0.5～1.0mm)。能產生尿素酶、過氧化氫酶、脂酶、磷脂酶和蛋白酶。細菌對外環境的抵抗力不強，對干燥及熱均很敏感，多種常用消毒劑很容易將其殺滅。