反復性生殖器皰疹常在原發性生殖器皰疹后1～3個月內發生。臨床癥狀一般比原發性生殖器皰疹輕，但也有時輕時重者。反復的部位多在原發的地方或附近，亦可在不同的部位。反復癥狀的輕重、回數、頻率跟疲勞、飲酒、性生活、月經、飲食等因素有關。經過治療或服藥期間的發作癥狀常不典型或很輕微。

生殖器皰疹的癥狀表現多樣，主要有初發性癥狀、復發性癥狀、不典型癥狀、局部癥狀和全身癥狀等。 1.初發性癥狀：發病前局部有燒灼感、瘙癢感，很快出現紅斑、簇集性小丘疹和水皰，皰液清亮，數日后破潰形成糜爛或淺潰瘍，伴有疼痛。 2.復發性癥狀：較初發癥狀輕，水皰和潰瘍數量少、面積小，愈合較快，疼痛較輕。 3.不典型癥狀：可表現為亞臨床感染、局部裂隙、非特異性紅斑等。 4.局部癥狀：生殖器及周圍皮膚出現紅斑、丘疹、水皰、潰瘍，伴有燒灼感、疼痛、瘙癢。 5.全身癥狀：部分患者可有發熱、頭痛、乏力等不適。 總之，生殖器皰疹的癥狀因人而異，如有相關癥狀，應及時就醫，進行準確診斷和治療。

生殖器皰疹的皮損一般是單側分布，亦見雙側發病者。個別皮損可發生在大腿、臀部、骶部等遠離外陰生殖器的地方，可分別稱為大腿單純皰疹、臀部單純皰疹、骶部單純皰疹等。