生殖器皰疹具有潛伏期，一般來說，大約是在3～14天左右，平均大約是在6天。主要的發病部位就是龜頭、冠狀溝、包皮、陰莖；而對于女性的生殖器皰疹疾病來說，最常見的癥狀就是外陰、宮頸、肛周及臀部，主要的表現形式就是粟粒大丘疹、水皰，可彼此融合成片。除此之外，患者也還會出現一定程度上的排尿異常。由于生殖器皰疹與不潔性生活有關，所以在治療期間要注意避免再次傳染，同時也為了傳染給其他人，所以要禁止性生活。發熱、月經、精神創傷、酗酒、食物都是誘發或者加速生殖器皰疹的因素，所以在避免這些情況的發生。

生殖性皰疹潛伏期短，早期沒有典型臨床癥狀，不容易被發現。生殖器瘙癢已經僅有的癥狀，后期紅疹數目增多后，瘙癢癥狀更為明顯。數日后，紅疹變為水皰，潰破、糜爛，流出膿性液體，侵及其他位置，又再起紅疹。紅疹變為水皰，結痂后疾病即康復。治療生殖器皰疹，需要患者改掉以前的飲食習慣，注意一些辛辣的食物盡量少吃，在生活中，如果患者比較喜歡吃辛辣刺激性食物，一定要改變自己的飲食習慣。生姜、辣椒、羊肉、牛肉及煎炸食物等辛辣溫熱之品，食后易助火生熱，中醫認為，本病為濕熱火毒蘊結肌膚所生，故皰疹患者應忌食上述辛辣食品。

生殖器皰疹潛伏期后，男性龜頭、陰莖、尿道口、陰囊和大腿、臀部等處，女性陰唇、子宮頸、外陰等處出現灼熱感或刺痛，生殖器皰疹患者隨即出現紅斑伴群集瘙癢的小紅丘疹并迅速變為多發性水皰，亦可變成膿皰。生殖器皰疹癥狀為自覺局部灼熱感、瘙癢、疼痛明顯，并可有排尿困難(及步行困難。生殖器皰疹主要通過性生活傳播。發病快傳能力強，容易長出來。期間要休息增加營養不要熬夜，提高身體免疫力，不要有性生活。最好性伙伴一同治療，以免交叉感染。