甲胎蛋白很高卻沒查出肝癌，可能由多種因素導致，如良性肝臟疾病、生殖細胞腫瘤、檢測誤差、其他惡性腫瘤、特殊生理狀態等。 1.良性肝臟疾病：例如急慢性肝炎、肝硬化等，肝臟細胞受損和再生，可能導致甲胎蛋白升高。 2.生殖細胞腫瘤：像睪丸癌、卵巢癌等生殖細胞腫瘤，有時也會引起甲胎蛋白水平上升。 3.檢測誤差：檢測過程中樣本污染、操作不當或儀器故障等，都可能造成結果不準確。 4.其他惡性腫瘤：胃癌、胰腺癌等，部分情況下也會分泌甲胎蛋白，導致其數值升高。 5.特殊生理狀態：孕婦在懷孕 3-4 個月時，甲胎蛋白會升高，產后 3 周左右可恢復正常。 總之，甲胎蛋白升高不一定意味著患有肝癌，需要綜合臨床癥狀、其他檢查結果等進行判斷。如果發現甲胎蛋白異常升高，應及時到正規醫院進一步檢查，以明確原因。

AFP是肝癌最特異的標志物，AFP超過400微克/升時，如果能排除其他疾病的存在，就要高度懷疑肝癌了。這些疾病包括急性肝炎、慢性活動性肝炎、肝硬化、生殖細胞性腫瘤等。　　建議首先去條件更好的醫院復查，如果排除了檢驗誤差，就應高度懷疑肝癌。因為“小三陽”病人由于乙肝病毒在肝細胞內復制增殖，使肝細胞處于損傷、修復和再生的過程，因此，AFP會升高，但濃度一般不超過400微克/升，并常與轉氨酶水平有明顯相關性。雖然個別病人也可以高達800微克/升，但是，隨著肝炎的好轉和轉氨酶的下降，AFP亦隨之下降，進而逐漸恢復正常，或長期保持100微克/升以下的低濃度水平。　　其次，應定期檢測AFP水平，如果持續升高超過4周，即使CT檢查陰性（即發現不了肝癌）也要高度懷疑肝癌。因為只要有0.1～0.2厘米的肝癌病灶存在，血液中的AFP就會明顯升高。建議作進一步檢查，如肝動脈造影和造影后碘油CT掃描等，能提高微小病灶的檢出率。　　由于肝癌發展速度較快，早期肝癌和晚期肝癌的治療效果完全不同。因此，不要因為肝功能正常，B超和CT檢查無事就放松警惕，延誤了最佳的診斷和治療時機。