非口源性口臭可能由呼吸系統疾病、消化系統疾病、內分泌系統疾病、腎臟疾病、血液系統疾病等引起。 1.呼吸系統疾病：如慢性鼻竇炎、萎縮性鼻炎等。鼻腔、鼻竇的炎癥會產生膿性分泌物，導致異味。 2.消化系統疾病：像幽門螺桿菌感染引起的胃炎、胃潰瘍，胃內食物消化不良，產生異味經口腔散發。還有肝硬化、肝衰竭等肝臟疾病，影響代謝，也可能導致口臭。 3.內分泌系統疾病：糖尿病患者血糖控制不佳時，體內酮體增多，可出現爛蘋果味口臭。 4.腎臟疾病：慢性腎衰竭患者，體內代謝廢物不能有效排出，蓄積后可產生尿騷味口臭。 5.血液系統疾病：白血病患者，由于白細胞異常增生，代謝產物增多，可能出現口臭。 總之，非口源性口臭的原因較為復雜。如果出現口臭且排除口腔問題，應及時就醫，明確病因，進行針對性治療。

絕大多數的口臭是由口腔因素引起的。口源性口臭占口臭的70%-90%，非口源性來源的口臭，如呼吸道來源的口臭，可由鼻腔、咽喉、氣管、肺疾患引起。由血液攜帶來源的口臭，惡臭的揮發性物質可從全身各個部位(如胃腸道、肝臟等)進入血液中，經血液帶到肺泡隨氣體變換而呼出。發生在患有系統疾病患者中，胃腸疾病是最多見又易為人們所忽視的。糖尿病也可以引起口臭。大多數糖尿病患者都伴有不同程度的免疫功能障礙，口腔中的致病菌增多，因此引起牙齦炎和牙周炎，產生難聞的氣味。病毒性肝炎、酒精性肝炎、肝癌、腎功能不全等疾病也會表現出口腔有異味。口臭的產生是細菌分解蛋白的代謝過程(腐敗作用)的結果。微生物存在是口臭產生的必要條件，口臭的存在與否與腐敗作用的強弱直接相關。有許多因素可以影響細菌的腐敗作用，如酸性環境能抑制氨基酸腐敗所需的酶活性，致臭物質產生減少，堿性環境則相反。口腔唾液減少，清潔作用能力減弱也會使代謝產物大量堆積、腐敗作用加重。