新輔助治療結直腸癌可能存在一些潛在缺點，如治療相關不良反應、治療周期長、可能影響手術時機、治療效果不確定、增加經濟負擔等。 1.治療相關不良反應：新輔助治療可能引起惡心、嘔吐、脫發、骨髓抑制等不良反應。例如，化療藥物奧沙利鉑可能導致神經毒性，氟尿嘧啶可能引起胃腸道反應。 2.治療周期長：通常需要數周甚至數月，這可能導致患者心理壓力增大，生活質量下降。 3.可能影響手術時機：若腫瘤對新輔助治療反應不佳，可能延誤最佳手術時機。 4.治療效果不確定：不是所有患者都能從新輔助治療中顯著獲益，部分患者可能出現腫瘤進展。 5.增加經濟負擔：新輔助治療涉及多種檢查和藥物，費用較高，給患者家庭帶來經濟壓力。 總之，新輔助治療結直腸癌雖然具有一定的優勢，但也存在上述潛在缺點。患者在選擇治療方案時，應與醫生充分溝通，權衡利弊，做出最適合自己的決策。

(1)化療誘導的肝損傷； (2)可能因為腫瘤早期進展，錯過 “手術機會的窗口期” ；(3)新輔助化療獲得完全緩解而使手術切除范圍的確定變得異常困難，而手術范圍的不確定可能導致術后腫瘤細胞的殘留，最近的研究表明，結直腸癌肝轉移接受術前新輔助化療后，盡管CT顯示獲得了完全緩解，但對原來腫瘤部位進行病理檢查后發現在大多數的原轉移瘤部位仍然有存活的腫瘤細胞。