血吸蟲病的癥狀多樣，常需與病毒性肝炎、傷寒、細菌性痢疾、阿米巴痢疾、瘧疾等疾病進行鑒別診斷。 1. 病毒性肝炎：多由病毒感染引起，常有乏力、食欲不振、黃疸等癥狀。通過肝功能檢查、病毒標志物檢測等可鑒別。 2. 傷寒：由傷寒桿菌引起，持續發熱、相對緩脈、全身中毒癥狀等是其特點。血培養、肥達反應有助于鑒別。 3. 細菌性痢疾：常有腹痛、腹瀉、黏液膿血便。糞便培養出痢疾桿菌可明確診斷。 4. 阿米巴痢疾：多有果醬樣大便，糞便中找到阿米巴滋養體可確診。 5. 瘧疾：周期性發作的寒戰、高熱、出汗是主要表現。血涂片查瘧原蟲可鑒別。 總之，對于疑似血吸蟲病的患者，需要綜合臨床表現、實驗室檢查等多方面進行判斷，以明確診斷，從而采取合適的治療措施。

1.急性血吸蟲病須與敗血癥、瘧疾、傷寒與副傷寒，急性粟粒性肺結核，病毒感染，其他腸道疾病鑒別。主要根據籍貫、職業、流行季節，疫水接觸史、高熱、肝臟腫大伴壓痛、嗜酸性粒細胞增多，大便孵化陽性為鑒別要點。2.慢性血吸蟲病須與慢性菌痢、阿米巴痢疾、潰瘍性結腸炎、腸結核、直腸癌等病鑒別。糞便孵化血吸蟲毛蚴陽性可確診。嗜酸性粒細胞增生有助于本病之診斷。腸鏡檢查及組織檢查可有助于確診。糞便常規檢查、培養、X線鋇劑灌腸，診斷性治療有助于診斷與鑒別診斷。3.晚期血吸蟲病須與門脈性肝硬變及其他原因所致的肝硬變鑒別。血吸蟲病肝硬變的門脈高壓所引起的肝脾腫大、腹水（脾水）、腹壁靜脈怒張改變較為突出，肝細胞功能改變較輕，肝表面高低不平。門靜脈性肝硬變表現為乏力，厭食、黃疸、血管痣、肝腫大顯著甚至縮小，不易摸到表面結節，且有活動性肝功改變，如轉氨酶增高等。4.異位血吸蟲病肺血吸蟲病須與支氣管炎、粟粒性肺結核，肺吸蟲病鑒別。急性腦血吸蟲病應與流行性乙型腦炎鑒別。慢性腦血吸蟲病應與腦瘤及癲癇鑒別。