大便失禁主要需與肛門直腸損傷、神經源性腸道功能障礙、肛管直腸脫垂、潰瘍性結腸炎、先天性肛門直腸畸形等疾病相鑒別。 1.肛門直腸損傷：多由外傷或手術導致，常有肛門疼痛、出血等癥狀。通過肛門指診、直腸鏡等檢查可明確診斷。 2.神經源性腸道功能障礙：常見于神經系統疾病，如脊髓損傷、多發性硬化等。表現為排便反射異常，需進行神經電生理檢查等。 3.肛管直腸脫垂：直腸黏膜或直腸全層脫出肛門外，可伴有肛門失禁，通過肛門視診和直腸指診可診斷。 4.潰瘍性結腸炎：腸道炎癥性疾病，除大便失禁外，還有腹瀉、膿血便等，依靠結腸鏡及病理檢查確診。 5.先天性肛門直腸畸形：出生即存在，肛門形態或位置異常，導致排便控制障礙，通過體格檢查和影像學檢查判斷。 總之，大便失禁的鑒別診斷需要綜合考慮癥狀、體征及相關檢查結果，以明確病因，采取針對性治療。

主要與急性菌痢及急性腸炎等腹瀉患者偶爾出現的大便失控相鑒別，但這些患者的大便多數情況下能隨意控制，并且患者多有腹痛及膿血便或水樣便，經對癥治療后，隨著腹瀉癥狀的緩解、大便成形，而偶發的大便失禁消失。大便失禁主要是病因之間的鑒別，包括神經障礙和損傷、肌肉功能障礙和受損、先天性疾病等。