HSV-1主要是通過呼吸道、皮膚和粘膜密切接觸傳播，感染腰以上部位的皮膚粘膜和器官。如引起口唇粘膜、鼻前庭、眼結膜、咽喉部的炎癥及皰疹，口和口周圍發生的皰疹，99%是由Ⅰ型皰疹病毒感染引起的。 HSV-2在男性好發于龜頭、冠狀溝、尿道口、陰莖、陰囊、大腿和臂部等處。女性好發于陰唇、陰阜、陰蒂、肛周或陰道。約90%的病人，病毒可同時侵犯子宮頸，出現陰道分泌物增多或下腹痛，并可并發宮頸炎和子宮炎。大多數男女病人雙側腹股溝淋巴結腫大。后期炎癥波及尿道、膀胱時，可出現排尿困難、尿痛、尿頻、嚴重者可發生尿潴留等現象。此外，還可能有其它癥狀同時出現，如發熱、全身不適、頭痛、頸項強直、腦膜炎和骶部神經系統功能不全。此病女性多于男性，癥狀也較男性嚴重。在發病人中約10%有咽炎，10%男性與26%女性的原發性生殖器皰疹病人同時伴有生殖器以外的病損，主要在臂部與手指，常見生殖器出現皰疹后的第2周，大多是受感染的生殖器部位的病毒自身接種而致。