感染是腎病綜合征的常見并發癥，包括細菌、病毒及霉菌感染等，其中以血行播散性結核及深部霉菌感染最嚴重，可威脅病人生命。感染的防治原則是：①不盲目給用激素及細胞毒藥物的病人并用抗生素"預防"感染，這不但不能防止細播菌感染，反易導致霉菌感染發生。②病人一旦出現感染，即應盡快選用敏感、強效、無腎毒性的藥物進行治療（如血行播散性結核用異煙肼、乙胺丁醇及匹嗪酰胺四聯治療，深部霉菌感染用氟康唑靜脈點滴治療等），并加強支持療法。③反復感染者，可輔以免疫增強劑（如胸腺肽肌肉注射、丙種球蛋白5g靜脈點滴）治療，減少感染發生。

血栓及栓塞是腎病綜合征的另一常見并發癥，膜性腎病尤易發生。此并發癥重在預防，主要措施是：①腎病綜合征病人均應給予抗血小板治療（雙密達莫300mg/d或阿司匹林 100mg/d）；②血漿蛋白低于20g/L的腎病綜合征病人，還應進行抗凝治療：常予肝素鈣50mg，q12 h皮下注射1次（肝素鈣吸收代謝較慢，故可每日注射兩次），或肝素鈉25mg,q6 h皮下注射一次（肝素鈉體內吸收代謝快，4~6 h作用消失，必須反復注射），以保持凝血時間（試管法）達正常2倍；③血栓栓塞一旦發生，即應盡快進行溶栓治療（6 h內最佳，3日內仍可望有效）：臨床常用尿激酶（20萬單位/d靜脈點滴），近年基因重組的組織型纖溶酶原激活劑（rT-PA）問世，溶栓效果優于尿激酶，亦可試用。出現血栓栓塞的病人還需持續抗凝半年以上，以防新血栓栓塞再發，此時常選口服抗凝藥服用（如華法令或其它雙香豆素類制劑），需保持凝血酶原時間達正常的2倍。

腎病綜合征本身可引起一種機制欠清的特發性急性腎功能衰竭，可能與腎間質水腫壓迫腎小管及原尿中大量蛋白在少尿時與Tamm-Horsfall蛋白共同形成管型堵塞腎小管，導致"腎單位內梗阻性腎病"相關。該急性腎衰竭的主要治療措施為：①血液透析。除維持生命外，可在補充血漿制品后適當脫水，以減輕組織（包括腎間質）水腫；②利尿。對袢利尿劑仍有反應時，應積極給予，以沖刷掉阻塞腎小管的管型。③積極治療基礎腎小球病。由于導致特發性急性腎衰竭的多數原發性病例為微小病變病，故對強化治療（如甲基強的松龍沖擊治療）反應十分良好。隨著尿量增多急性腎衰竭逆轉，但是基礎病若為局灶節段性腎小球硬化等激素抵抗性疾病時，病人預后差，急性腎衰竭可能無法恢復。