少數勃起功能障礙患者（約占15%）由于對非創傷性治療無效，為進一步了解勃起功能障礙的確切發病原因或機制，需要有選擇地作下列項目中的某些檢查。（1）夜間陰莖勃起試驗（NPT）臨床上可幫助區分心理性還是器質性ED。（2）陰莖海綿體注射血管活性藥物試驗（ICI）陰莖海綿體注射血管活性藥物能誘導精神性、神經性、激素性及輕度血管性ED患者的陰莖勃起，特別是神經性ED患者。（3）彩色雙功能超聲檢查（CDU）該檢查無創傷，可在門診進行。（4）陰莖海綿體測壓（CM）該法是診斷靜脈性勃起功能障礙的有效方法。（5）陰莖海綿體造影1981年Wespes等首次將陰莖海綿體灌注造影術用于臨床，提高了對靜脈性ED的認識，同時也為靜脈性ED的治療提供了依據。（6）選擇性陰莖動脈造影動脈造影仍然是評估陰莖血供異常的定位和定性的主要方法。（7）勃起功能障礙的神經檢測在勃起反應的神經傳導過程中，自主神經系統起著重要的作用。（8）海綿體活檢海綿體平滑肌細胞和海綿體腔隙的病理改變如平滑肌數量減少，細胞超微結構改變及大量纖維組織增生可降低平滑肌細胞和海綿竇的順應性和彈性，從而造成動脈充盈不足和靜脈阻斷不全，進而導致勃起不堅。陰莖海綿體活檢可以直接評價海綿體功能，在某些陽萎患者的病因診斷中非常必要。