治療主要是甲狀腺激素替代治療，甲減可分為重型和輕型，前者癥狀明顯，常呈粘液性水腫表現，后者癥狀較輕或不典型。主要的表現有低基礎代謝率癥群：疲乏，行動遲緩，嗜睡，記憶力明顯減退，且注意力不集中，因周圍血循環差和能量產生降低以致異常怕冷、無汗及體溫低于正常。粘液性水腫面容、皮膚蒼白、精神遲鈍，嗜睡，理解力和記憶力減退。目力、聽覺、觸覺、嗅覺均遲鈍，伴有耳鳴，頭暈。嚴重者可有精神失常，呈木僵、癡呆，昏睡狀，肌肉松弛無力，心血管系統癥狀、消化系統以及內分泌、呼吸系統等各個系統的癥狀。若是因為藥物導致的甲減，減量或停用后，甲減可以自行消失；若是下丘腦或垂體有大腫瘤，行腫瘤切除后，甲減有可能得到不同程度的改善。

1)甲狀腺的發育不良,缺如和異位：是先天性甲減最常見的原因.近年研究先天性甲減患兒母親存在一種能阻斷誘導甲狀腺生長抗體,這種抗體可干擾甲狀腺發育.自身免疫性甲狀腺炎孕婦體內存在一種免疫球蛋白,可通過胎盤抑制胎兒的甲狀腺發育.甲狀腺發育不良的患兒中,部分可能與甲狀腺轉移因子基因和基因突變有關.動物實驗證實部分甲減與促甲狀腺受體基因突變有關.
2)甲狀腺激素合成障礙：甲狀腺合成時需各種酶參與,因某種酶如過氧化酶,偶聯酶,脫碘酶和甲狀腺蛋白合成酶缺陷導致甲狀腺合成障礙.本病常有家族史,大多數為常染色體隱性遺傳.
3)下丘腦-垂體性甲減：較為少見,部分伴有其他下丘腦-垂體激素缺乏.