懷孕三個月時出現小腹疼痛難忍且頻繁跑廁所，可能是由于子宮增大、腸道問題、先兆流產、泌尿系統感染、宮外孕等因素引起。自行處理身體不適可能加重病情，及時就醫并遵循醫生的治療方案是關鍵。
1.子宮增大：孕期子宮逐漸增大，可能會對周圍組織產生牽拉和壓迫，導致輕微腹痛，但通常不會疼痛難忍。
2.腸道問題：如腸炎、腸痙攣等，可能因飲食不當、腹部著涼等引發，會有腹痛、腹瀉癥狀。
3.先兆流產：多伴有陰道流血，腹痛常為陣發性下腹部墜痛。
4.泌尿系統感染：尿頻、尿急、尿痛，下腹疼痛，多因細菌感染所致。
5.宮外孕：受精卵在子宮腔外著床，會出現一側下腹部劇痛，常伴有陰道流血。
出現這種情況應盡快就醫，進行相關檢查，如B超、血檢等，以明確原因，并采取相應的治療措施。孕期用藥需謹慎，務必遵醫囑。

關鍵看你這個腹瀉是病毒感染還是細菌感染還是消化不良的可能才能判斷.我建議你看看醫生,控制腹瀉.對小孩可以暫時觀察