陰莖的發生與發育過程分為四個階段：
　　(1)妊娠第10-12周,陰莖剛剛分化好,只有3.5毫米長,這時起作用的是在胎盤分泌的hCG作用下而產生的睪酮.
　　(2)妊娠的中,后期6個月,陰莖生長速度很快,出生時已達2.5-3.5厘米,這時胎兒垂體開始分泌促性腺激素LH和FSH.
　　(3)出生后至青春期前（7歲左右）,陰莖生長緩慢,這是因為下丘腦,垂體發育慢,睪酮水平也低的緣故.
　　(4)青春期開始后,垂體和睪丸激素分泌旺盛,陰莖迅速生長,僅5年左右就達到成人水平,增長增粗.當老年性激素水平顯著降低或外科去勢后,陰莖可繼發性退化.若繼發性陽痿停止性接觸多年之后,也有可能造成病理性退化,這不是一般所說的用進廢退問題,而是平滑肌纖維發生退行性變化的后果.　　總之,陰莖的分化與發育全靠體內的睪酮水平,如果妊娠第6-9個月期間,睪酮分泌不足,陰莖發育低于正常速度,出生時陰莖便較小.　　那么,怎樣才算是真正的小陰莖呢?陰莖在青春期前短于2.5厘米,青春期后短于5厘米,而且發育不正常,沒有勃起功能；特別是第二性征發育不良,性功能障礙,無生育力,無精子,這時方可認為是陰莖發育不正常.