孩子患手足口腦炎后睡覺手腳驚跳，可能與病毒對神經系統的損害、炎癥反應、電解質紊亂、神經興奮性增高、心理因素等有關。這種情況需引起重視，建議及時就醫。若身體出現異常癥狀，請立刻就診，根據醫生的囑咐進行治療，切勿自行用藥。
1.神經系統損害：手足口病病毒侵犯腦部神經，影響神經功能，導致神經傳導異常，引起手腳驚跳。
2.炎癥反應：腦炎導致的腦部炎癥，使神經處于敏感狀態，容易出現異常放電，引發驚跳。
3.電解質紊亂：患病期間可能出現鉀、鈣等電解質失衡，影響肌肉和神經的正常功能。
4.神經興奮性增高：腦炎可能導致神經興奮性增高，使肌肉容易出現不自主收縮。
5.心理因素：孩子患病后可能會感到緊張、恐懼，心理狀態的改變也可能表現為身體的異常反應。
總之，孩子手足口腦炎后睡覺手腳驚跳的原因較為復雜。家長應帶孩子到正規醫院的兒科或神經內科就診，醫生會根據具體情況進行相關檢查，如腦電圖、電解質檢測等，以明確原因，并給予相應的治療。治療可能包括營養神經、調節電解質平衡等，常用藥物有甲鈷胺、維生素B1等，但需遵醫囑使用。

不考慮為腦部的實質性傷害，可能與腦炎的恢復有關。等孩子年齡大一點的時候可以自行恢復正常，不需要做檢查。