陰莖根部附近疼痛可能由多種原因引起，如炎癥感染、外傷、精索靜脈曲張、泌尿系統結石、腫瘤等。身體不適時，要及時看醫生，根據醫囑進行治療，切勿自己胡亂用藥。
1.炎癥感染：如尿道炎、前列腺炎、附睪炎等，多因細菌、病毒等病原體侵襲所致。癥狀除疼痛外，還可能有尿頻、尿急、尿痛等。治療常使用抗生素，如左氧氟沙星、頭孢呋辛酯、阿莫西林等，需遵醫囑用藥。
2.外傷：性生活過于劇烈或外部撞擊等導致局部損傷，引起疼痛。一般需要休息，若有傷口需清創處理。
3.精索靜脈曲張：精索內靜脈回流障礙，血液淤積，可出現疼痛，尤其在久站或勞累后加重。輕度可保守治療，嚴重時需手術。
4.泌尿系統結石：結石在輸尿管或膀胱內移動，可能導致陰莖根部放射性疼痛，還可能伴有血尿。較小結石可通過多喝水、運動排出，大結石可能需體外碎石或手術。
5.腫瘤：陰莖或周圍組織的腫瘤，早期可能僅表現為隱痛。確診后通常需手術、放療、化療等綜合治療。
總之，陰莖根部附近疼痛的原因多樣。如果出現這種情況，應及時到正規醫院泌尿外科就診，進行相關檢查，如尿常規、超聲等，以明確病因，并采取相應的治療措施。