陰莖根部疼痛可能由多種原因引起，如外傷、炎癥、精索靜脈曲張、腫瘤、神經因素等。一旦身體出現不適，應立刻就醫，遵從醫生的指示進行治療，不宜自行開藥。
1.外傷：陰莖根部受到外力撞擊或擠壓，導致局部組織損傷，從而引起疼痛。
2.炎癥：尿道炎、附睪炎、精囊炎等炎癥感染，炎癥蔓延可導致陰莖根部疼痛，常伴有尿頻、尿急、尿痛等癥狀。
3.精索靜脈曲張：精索內靜脈回流受阻，血液淤積，可出現陰囊墜脹、疼痛，疼痛有時可放射至陰莖根部。
4.腫瘤：陰莖根部的腫瘤，如脂肪瘤、纖維瘤等，腫瘤生長壓迫周圍組織可引起疼痛。
5.神經因素：支配陰莖根部的神經受到刺激或損傷，如腰椎間盤突出壓迫神經，也可能導致疼痛。
6.性生活不當：性生活過于頻繁、激烈，或性生活姿勢不正確，可能造成陰莖根部肌肉拉傷，引發疼痛。
總之，陰莖根部疼痛的原因較為復雜。一旦出現這種癥狀，應及時到正規醫院就診，進行詳細的檢查，如尿常規、血常規、B 超等，以明確病因，并在醫生的指導下進行針對性治療。同時，要注意保持生殖器部位的清潔衛生，避免過度勞累和不潔性生活。