兩個多月寶寶半夜總咳嗽，可能是環境因素、呼吸道感染、過敏、胃食管反流、先天性呼吸系統結構異常等原因造成的。面對身體的不適，最明智的選擇是立即就醫，并在醫生的指導下進行規范治療，確保安全有效。
1.環境因素：寶寶所處的房間空氣干燥、溫度過高或過低，都可能刺激呼吸道，導致咳嗽。要保持室內適宜的溫度（22-26℃）和濕度（50%-60%），經常通風換氣。
2.呼吸道感染：如感冒、支氣管炎等，多由病毒或細菌引起。病毒感染一般具有自限性，可先觀察；細菌感染則可能需要使用抗生素，如阿莫西林顆粒、阿奇霉素干混懸劑等，但需在醫生指導下用藥。
3.過敏：寶寶可能對空氣中的花粉、塵螨等過敏，引發咳嗽。要注意保持室內清潔，減少過敏原。
4.胃食管反流：寶寶胃容量小，胃呈水平位，容易出現反流，胃酸刺激咽部引起咳嗽。喂奶后要及時拍嗝，可適當抬高寶寶上半身。
5.先天性呼吸系統結構異常：這種情況較為少見，如氣管軟化等。需要通過專業檢查確診，必要時進行手術治療。
總之，寶寶半夜總咳嗽的原因較多，如果咳嗽持續不好轉或伴有發熱、呼吸急促等癥狀，應及時帶寶寶到正規醫院的小兒科就診，查明原因，對癥治療。