小兒感染HIV后，約經過5年左右的潛伏期才出現癥狀，絕大多數宮內HIV感染的嬰兒在出生時無臨床癥狀，體格檢查正常，15%～25%圍生期HIV感染的嬰兒在生后數月發病，以后每年約以10%的比例增加，發病后在1～5年內死亡，少數病兒可存活9年或更長，故小兒艾滋病的臨床經過較成人艾滋病更為兇險，在確診艾滋病之前，患兒常出現一些非特異性的臨床表現，包括輕度生長遲緩，肝脾腫大，全身淋巴結腫大，間歇發熱，非特異性間歇性腹瀉和慢性皮膚感染等，

小兒艾滋病的癥狀：
1）體重不增，近3-6個月內體重減輕在10%以上，營養不良，發育異常、畸形；
2）3/4的患兒有全身淋巴結腫大，明顯的霉菌或其他條件致病菌感染，機會性感染，反復細菌感染，如敗血癥、中耳炎等，肝、脾腫大、系統性淋巴瘤，腮腺腫大等；
3）肺部炎癥，最常見的是卡氏肺囊蟲肺炎，此外還有淋巴間質性肺炎和肺淋巴樣增生；
4）慢性腹瀉；
5）神經系統損害引起艾滋病腦病，小兒出現頭暈、頭痛、智障、進行性癡呆、幻覺、癲癇、肢體癱瘓、運動失調等癥狀，也可有腦膜腦炎、顱神經炎等表現；
6）血小板減少；
7）粘膜皮膚感染、皮膚粘膜念珠菌感染；
8）惡性腫瘤等。