1.顱內壓增高癥狀 生殖細胞瘤可早期壓迫或梗阻導水管的上端開口，引起梗阻性腦積水，當腫瘤進一步增大時，壓迫第叁腦室后部或導水管上端，使梗阻性腦積水更為突出，因此，幾乎所有的病人都有顱內壓增高的癥狀及體征。主要表現為頭痛、惡心嘔吐、復視、視盤水腫，小兒可有頭圍擴大等。后期可繼發視神經萎縮及展神經麻痹等。
2.局部定位征 最常見的定位癥狀有Parinaud 綜合征，這是Parinaud 于1883 年首先指出松果體區腫瘤可出現上視不能、瞳孔光反應和調節反應障礙等。其中部分病人同時合并下視不能，瞳孔光反應遲鈍或喪夫、調節反應減弱及阿羅瞳孔是生殖細胞瘤的重要體征。約半數以上的病人可出現小腦癥狀，表現為持物不穩、走路搖晃、眼球震顫等，少數侵犯基底節時可出現偏癱等。腫瘤壓迫下丘腦及內側膝狀體可出現雙側耳鳴及聽下降。其他尚包括癲癇、腦神經(Ⅲ、Ⅳ)不全麻痹、視野缺損等。
3.內分泌癥狀 性早熟及巨生殖器為本病突出的內分泌癥狀，因此具有較大的診斷價值。但也可見到性發育停頓或遲緩。性發育障礙在15 歲以下的兒童發生率為10%～
37.5%。性早熟以男性病例占大多數。下丘腦損害可出現尿崩癥、嗜睡、肥胖、發育障礙及性功能低下等。
4.轉移 由于生殖細胞瘤組織松散，很易脫落，故有種植性轉移傾向，常沿蛛網膜下腔向基底池、腦室系統和脊髓轉移。
其轉移率一般在10%～37%之間。個別病例可發生顱外遠處轉移，如頭皮下、肺部等。

顱內壓增高 頭痛 惡心與嘔吐 視障礙 性發育停頓 阿羅瞳孔