非結核分枝桿菌病的預后受多種因素影響，包括病菌類型、治療敏感性、患者自身狀況、是否合并感染及疾病類型等。健康無小事，身體不適切莫忽視。及時就醫，根據醫生指導進行治療，早日恢復健康。
1.病菌類型：如堪薩斯分枝桿菌肺病多為原發，對多種藥物敏感，預后較好；胞內、龜及偶發分枝桿菌肺病多為繼發，缺少敏感藥物，預后較差。
2.治療敏感性：有敏感藥物治療的預后較好，缺少則較差。
3.患者自身狀況：年齡較輕、身體狀況好的預后相對較好，年齡大的預后較差。
4.合并感染情況：未與人型結核菌或HIV等混合感染的預后較好，反之較差。
5.疾病類型：原發非結核分枝桿菌肺病預后好于繼發的，非播散型好于播散型。
總之，非結核分枝桿菌病的預后因人而異，需要綜合多種因素判斷。

預后： 各種NTM引起的非結核分枝桿菌肺病預后不同。原發非結核分枝桿菌肺病、有敏感藥物治療的、有手術適應證的、年齡較輕的、非播散型的、未與人型結核菌或HIV等混合感染的非結核分枝桿菌肺病預后較好，如堪薩斯分枝桿菌肺病多為原發性，對多種藥物敏感，預后較好。反之，繼發的、缺少敏感藥物治療的、沒有手術適應證的、年齡較大的、播散型的、與結核菌或HIV等病原微生物混合感染的預后較差，如胞內、龗及偶發分枝桿菌肺病多為繼發的，缺少敏感的藥物治療，預后較差。